Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Nicotiana tabacum var. TN90) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Nicotiana tabacum

CDS Sequence

CDS ID	lcl\|NW_015898598.1_cds_XP_016448633.1_43265
CDS Infomation	[gene=LOC107773723] [db_xref=GeneID:107773723] [protein=phytochrome C-like] [protein_id=XP_016448633.1] [location=join(74067..76107,76627..77443,78738..79034,80610..80820)] [gbkey=CDS]
Sequence	ATGTCTTCTAAATCTACAACAAGCAAGACTAATTGCTCTAGGAGCAGTTCAGCTAGGTCT AGACATGGTGCTCGTGTTGTTGCTCAAACCCCAATTGATGCAAAGCTCCACGTGGAGTTT GAAGAGTCTGAGCAGCAATTTGATTACTCTAATTCAGTTAACTTATCAAATTCCACTAGC AATGTTCCATCTTCAACTGTATCTGCTTATCTCCAGGAAATGCAAAGGGGAAGTCTAATT CAGCCATTTGGTTGTATGATTGCTATTGATGAGCAAAACTTCACTGTCATTGCGTATAGC GAAAATGCACCAGAAATGTTGGACTTGATACCTCATGCCGTTCCGAGCATCGAACAGCAA GAGGCTTTGACCTTTGGAACTGATGTCAGGACACTTTTTCGATCTTCAGGTGCTTCCGCG CTTGAAAAAGCAGCTAGCTTTGGAGAACTTAGTTTGCTTAATCCTATTTTGGTTCATTGT AGAAACTTGGGTAAGCCTTTCTATGCGATTTTACACCGCATTGATGTTGGGTTAGTAATA GATTTGGAGGCTGTGAATCCAAATGATGTCCCTGTAACCGCAGCTGGAGCATTAAAATCT TATAAGCTAGCTGCTAAAGCTATTGGAAAATTACAATCTCTGCCGAGTGGAGATATATCG TTGTTATGTGATGTATTAGTTAGAGAAGTGAGTCATTTGACAGGCTATGATCGTGTTATG GTTTATAAATTCCATGAGGATGAACATGGGGAAGTTATTGCAGAATGTCGTAAGCCTGAA TTAGAACCTTACCTTGGCTTGCATTACCCTGCTACAGATATACCACAAGCTTCGAGATTT CTCTTCATGAAGAATAAGGTTAGGATGATATGCGATTGCTTAGCTCCACCAATTAGGGTG ATCCAAGACCCGAGACTGGCTCAGCCGCTGAGCCTTGGTGGATCCGCATTAAGAGCTCCT CACGGCTGTCATGCACAATACATGGCCAATATGGGTTCTATTGCATCTATAGTGATGTCT GTGATGATTAGCGAGGAAGATGACGAGTTGGATAGTGACAAGCAAATGGCAAGAAAACTG TGGGGTTTGGTAGTTTGCCATCACACTTGCCCTAGATTTCTTCCTTTTCCTTTGAGGTAC GCGTGTGAGTTCTTGGTTCAAGTTTTCAGTGTTCAGATCAATAAGGAAGTGGAAGTGGCA GCTCAACTTAGGGAAAAGCATATATTGCGAACTCAGACTGTTCTTTGTGACATGCTTCTA AGAGATGCTCCATTGGGAATCGTTAACCAGTCTCCTAATGTTATGGACCTTGTAAGGTGT GACGGGGCTGCACTTTACTATAGGAACAAACTCTGGTTGCTTGGTGTTACGCCAACGGAG TCCCAAATCAGAGATATAGCTGAATGGCTTAATGAATCTCATGGTAGTAGTACAGGTTTA AGCACCGATAGTCTCATGGAAGCTGGCTACCCAAGTGCTGCTGTGCTCGGTGATGCGGTA TGTGGAATGGCTGCTGTAAAAATAACTTCAAAAGATTTTCTCTTCTGGTTCCGCTCCCAC ACAGCTAAAGAGATCAAGTGGGGTGGTGAAAAACATGATCCTGGAGACAAGGGTGACGGA AGAAAGATGCACCCAAGGTCATCATTTAAAGCCTTTTTGGAGGTTGTTAAGCGGCGGAGC CTACCTTGGGAGGATGTGGAAATGGATGCAATCCATTCCCTGCAGCTGATATTGCGAGGG TCTTTGCAAGATGAGGTTGCTGATTGTTCTAAAATGATTGTGAATGTCCCTGCTGTAGAT ACCAGTATAGAGAGAGTGGATGAACTTCGTATTGTCACAAACGAAATGGTTCGACTCATT GAGACAGCATCAGTACCCATTTTGGCTGTTGATGCTTCAGGCCGTGTTAATGGATGGAAC TCTAAAGTTTCTGACTTAACGGGATTGCTTATAGAGAAAGCAATAGGTGTACCCTTGGTT GATTTGGTTATTGATGATACAACAAGCGCAATTAAGGGTGTGCTCTTCCTGGCTTTGCAA GGCAAGGAGGAGAAAAATGTAGAAATCAAACTCAAGACATTTGGTCCCCAAGAAAATGTC GGACCAATTACGTTAGTGGCTAATGCCTGCTGTAGTCGAGATGTAAAACAAAATATTGTT GGAGTTTGCTTTATTGGGCAAGATGTTACTGGGCTAAAACTCATTGAGGACAAATATAGC CGCATTCAAGGTGATTATGTTGGAATTGTCCGCAATCCCTCTCCTCTGATTCCTCCAATT TTTGTGATGGATGAACATGGAAGATGCGTGGAATGGAATGATGCTATGCACAAATTGACT GGGTTGAAGAGGGACGAGGTCATTGATCAAATGCTTCTTGGTGAGGTTTTCACAGTCAAT AATTTAGGTTGCAGGGTGAAAGATGAAAACACACTAACAAAGCTCAGGATATTATTGAAT AGAGTAATTGCTGGCTGGGAAGGTGAGAAATTGGTTTTTGGGTTATTTGATAAACAGGGT AAGTATATTGAAGCCTTAATTTCTGCAAATAAAAGGATTGATGGTGATGGTAAGGTAACT GGGGTCTTGTGCTTTCTGCATATTCCTAGTCCAGAACTTCAATATGCAATGCATGTGCAA AAGATGTCAGAACAAGCTGCTGAAAGTAGTCTAAATAAGTTGGCTTATGTTCGTCTTGAA CTAAAAAACCCTTTAAATGGGATCAAGTGCATTCAGAATCTGCTTAAATCTTCTGATTTA AGCAATGATCAAAGTCATTTGCTGAAGACAAGTACAATGTGTCAAGAACAACTAGCCAAG ATCATTGATGACACCGATATTGATAGCATTGAGGAATGCTATATGGAAATGAACTCTTGT GAGTTCAATCTTGGCGAAGTTGTTACAGTGGTCATCAATCAAGTTATGATTCTAAGTCAG GAGCGCAAGGTTCAGGTCACATGCGATTCACCTGTCGAACTATCAAACATGTACCTGATT GGTGACAGTTTGAGGCTTCAACAAGTCCTTTCTGACTTTTTGACCACAGTTATCCTCTTT ACTGTTCCTTTTGAAGATTCCTCTGTGGTGCTCAGAGTAATTCCAAGAAAGGAACGTATA GGGACCAAGATGCATGTCATGCATCTTGAATTCCGAATCACTCATCCAGCCCCAGGCGTA CCTGAAGAGCTAATTCAACAGATGTTCTACTACAGTCAGAGTATATCAAGGGAAGGTCTT GGCCTATACATCAGCCAGAAACTTGTTAAAATCATGAATGGAACCGTCCAGTATCTTCGG GAGGCGGAGAGATCCTCATTCATTATCTTCGTTGAATTTCCACTGACAGACCAGAGCAAC CACTAG

Peptide Sequence

PEP ID	XP_016448633.1
PEP Infomation	PREDICTED: phytochrome C-like [Nicotiana tabacum]
Sequence	MSSKSTTSKTNCSRSSSARSRHGARVVAQTPIDAKLHVEFEESEQQFDYSNSVNLSNSTS NVPSSTVSAYLQEMQRGSLIQPFGCMIAIDEQNFTVIAYSENAPEMLDLIPHAVPSIEQQ EALTFGTDVRTLFRSSGASALEKAASFGELSLLNPILVHCRNLGKPFYAILHRIDVGLVI DLEAVNPNDVPVTAAGALKSYKLAAKAIGKLQSLPSGDISLLCDVLVREVSHLTGYDRVM VYKFHEDEHGEVIAECRKPELEPYLGLHYPATDIPQASRFLFMKNKVRMICDCLAPPIRV IQDPRLAQPLSLGGSALRAPHGCHAQYMANMGSIASIVMSVMISEEDDELDSDKQMARKL WGLVVCHHTCPRFLPFPLRYACEFLVQVFSVQINKEVEVAAQLREKHILRTQTVLCDMLL RDAPLGIVNQSPNVMDLVRCDGAALYYRNKLWLLGVTPTESQIRDIAEWLNESHGSSTGL STDSLMEAGYPSAAVLGDAVCGMAAVKITSKDFLFWFRSHTAKEIKWGGEKHDPGDKGDG RKMHPRSSFKAFLEVVKRRSLPWEDVEMDAIHSLQLILRGSLQDEVADCSKMIVNVPAVD TSIERVDELRIVTNEMVRLIETASVPILAVDASGRVNGWNSKVSDLTGLLIEKAIGVPLV DLVIDDTTSAIKGVLFLALQGKEEKNVEIKLKTFGPQENVGPITLVANACCSRDVKQNIV GVCFIGQDVTGLKLIEDKYSRIQGDYVGIVRNPSPLIPPIFVMDEHGRCVEWNDAMHKLT GLKRDEVIDQMLLGEVFTVNNLGCRVKDENTLTKLRILLNRVIAGWEGEKLVFGLFDKQG KYIEALISANKRIDGDGKVTGVLCFLHIPSPELQYAMHVQKMSEQAAESSLNKLAYVRLE LKNPLNGIKCIQNLLKSSDLSNDQSHLLKTSTMCQEQLAKIIDDTDIDSIEECYMEMNSC EFNLGEVVTVVINQVMILSQERKVQVTCDSPVELSNMYLIGDSLRLQQVLSDFLTTVILF TVPFEDSSVVLRVIPRKERIGTKMHVMHLEFRITHPAPGVPEELIQQMFYYSQSISREGL GLYISQKLVKIMNGTVQYLREAERSSFIIFVEFPLTDQSNH

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.